A Hidra já foi uma das organizações de terrorismo mais poderosas do mundo, a simples menção de seu nome fazia tremer até os seres mais poderosos. Mas agora depois de vários revezes, está sofrendo uma grande reestruturação. Comandada por um homem que todos achavam estar morto, o mortífero Barão Von Strucker, ele planeja retomar a antiga glória da organização, e também a dominação global. Mas três heróis vão tentar impedir que os tentáculos da Hidra cubram o mundo novamente, são eles, o Demolidor, o Justiceiro e o Capitão América. Que o jogo comece...