Nas selvas da Colômbia, pessoas estão morrendo, vilarejos inteiros brutalmente massacrados por uma equipe de soldados que se movem nas sombras como fantasmas. Nas ruas de São Francisco, Logan descobre que os arquivos do antigo programa Arma X, o "passo-a-passo" para se construir super soldados encorbertos por Adamantium, como ele próprio, caíram nas mãos de uma maligna corporação, a Roxxon. Mais uma vez, parece que alguém está tentando fabricar a máquina de matar perfeita . Isto significa que é hora de Wolverine se envolver, e lembrá-los de que alguém já o fez.
